Kiinteistön laatuvirheiden yksi tyyppi on salainen virhe. Salaisesta virheestä on kyse, mikäli kiinteistössä, sillä olevissa rakennuksissa tai laitteissa on sellaisia merkittäviä vikoja tai puutteita, joita myyjä eikä ostaja ole voineet havaita ennen kaupantekoa. Kumpikaan kaupan osapuoli ei ole siten tiennyt eikä hän ole myöskään voinut tietää virheestä kauppaa tehtäessä. Salaisesta virheestä ei ole kyse, mikäli virhe olisi voitu havaita huolellisesti ennen kauppaa tehdyssä tarkastuksessa. 

Ostaja voi vedota salaiseen virheeseen, mikäli virhe on merkittävä. Käytännössä kyseeseen tulevat erityisesti rakennuksen merkittävät laatupuutteet. Esimerkkejä ovat piilevät rakenteiden kosteus- ja lahovauriot, joista saattaa aiheutua asukkaille terveyshaittaa. Arvioitaessa virheen merkittävyyttä otetaan huomioon kiinteistön kauppahinta sekä muut kaupan olosuhteet kuten rakennusten ikä ja kunto. Ostajalla on velvollisuus sietää vähäisiä puutteellisuuksia, mikäli kyse on salaisesta virheestä. Virheen merkittävyys ei määräydy pelkästään virheen korjaamisen euromääräisten kustannusten perusteella, mutta huomattavan suuret korjauskustannukset usein puoltavat salaisen virheen olemassaoloa.  

Ostajalla on oikeus vaatia salaisen virheen perusteella hinnanalennusta tai jopa kaupan purkua, jos virhe on olennainen.